結晶紫是一種可以和細胞核中的DNA結合的堿性染料，對細胞核染色。三苯甲烷染料和甲基紫是用于驗證淀粉樣物的第一個人工合成染料。甲基紫是四、五、六甲基副品紅堿的混合物，淀粉樣物的染色可能是由于甲基紫選擇性地對某種有色成分具有親和力，淀粉樣物的反應還遠遠不是特異性的，因為缺乏同其他組織成分區(qū)分的顯著的顏色變化；甲基紫染色切片采用水溶性封固劑封固是很必要的，因為局部的脫水作用會破壞紅色的多染性。
Leagene結晶紫/龍膽紫混合染色液(Crystal Violet Stain)主要由結晶紫、龍膽紫、乙醇等組成，是一種組織或細胞染色時常用的可以把細胞核染成深紫色的染色液，含有不同比例的結晶紫和龍膽紫。該試劑僅用于科研領域，不適用于臨床診斷或其他用途。
